Assumindo o IPMA responsabilidades ao nível do território nacional nos domínios da atmosfera e do mar, concentra os seus esforços de investigação em projetos que revertam para aplicações diretas com utilização na atividade operacional, na procura de uma melhoria progressiva da informação disponibilizada aos seus utilizadores, quer a oferta revista um carácter comercial, quer de serviço público e em particular, neste caso, com a preocupação orientada para a salvaguarda de pessoas e bens.
O prémio de Investigação e Desenvolvimento IPMA - Fátima Espírito Santo promovido pelo IPMA, tem o objetivo de premiar os trabalhos científicos/académicos na área da Meteorologia e do Clima para jovens investigadores até aos 35 anos. O valor do prémio é de 3.000,00 EUR (três mil euros), e destina-se a distinguir o melhor trabalho científico e/ou académico, apresentado a concurso.
A Diretiva-Quadro Estratégia Marinha (DQEM), é um projeto europeu em que o IPMA intervém na componente científica da avaliação do Bom Estado Ambiental (BEA) das áreas marinhas sob jurisdição portuguesa. A DQEM tem em atenção verificar a qualidade e a saúde do meio marinho nacional, de modo a garantir a saúde de Portugal e dos portugueses.