O Programa MOPPA vai ao encontro do plasmado, quer na PCP, quer no Plano Estratégico da Pequena Pesca 2022-2030 e tem por objetivo principal obter informação de base que permita melhorar a gestão e governança da pequena pesca costeira e da apanha, tendo em vista a exploração sustentada dos recursos e dos ecossistemas onde estas importantes atividades se desenvolvem.

Pretende-se, assim, com o Programa MOPPA promover a gestão sustentada da pequena pesca e da apanha numa perspetiva ecossistémica, baseada em informação científica, praticamente inexistente até à data, ou, se existe, é pontual e limitada no tempo, e numa aprofundada caracterização socioeconómica e de governança que permita obter dados igualmente inexistentes ou muito limitados.